Les premiers cours du Cyfoje ont eu lieu en 1986.
Cette  formation  est  le  fruit  d’une  collaboration  de quelques responsables de la Jeunesse Action Biblique (JAB)  avec  le  Bund  Evangelikaler  Schweizer  Jungschar (BESJ) et l’organisme fédéral J+S.
Le BESJ est une importante organisation de formation de moniteurs chrétiens pour la jeunesse en Suisse alémanique qui collabore également avec J+S.
Dès 1986, de nombreux jeunes ont suivi un ou plusieurs cours du Cyfoje, avec l’objectif de mieux servir leur Seigneur auprès de la jeunesse dans le cadre de leurs  Eglises  locales  respectives  ou  d’organisations chrétiennes.
En 1995, après de nombreux contacts, quelques responsables de différentes fédérations d’Eglises ont décidé de travailler ensemble à la direction du Cyfoje ce qui a conduit à l’intégration du cours de base « CFB ».
En 2005, vu l’étendue des activités, les responsables ont créé l’association indépendante et inter-dénominationelle Cyfoje.

Quelques statistiques au 1.10.2017

Cours	Premier cours	Tot cours	Tot participants
CFB	1995	22	388
CFJ	1986	31	456
CMJ	1986	14	248
CRJ	1990	8	77
CP	1990	19	504
CFM	2001	4	24
CPB	2007	8	149